火鍋主要的食品原料是肉類、各種蔬菜、菇類和海鮮類，肉類中含有病原微生物，如沙門菌、金黃色葡萄球菌和其他致病菌，這些菌侵入肌肉深部，食用前未充分加熱，可引起食物中毒；生冷蔬菜中含有腸道致病菌及寄生蟲卵，也需要加熱熟透后方可安全食用；菇類食品有些是可以食用的，有些是非食用菇類，非食用菇類含有有毒物質可以引起人的中毒，在食用中要注意區分；海鮮類食品中含有多種微生物和寄生蟲，有些微生物是可以使食品腐敗變質的，如弧菌、黃桿菌等。由于吃火鍋的過程主要是消費者自己用生冷的原料進行加熱，待煮熟后食用，因此，在加熱過程中消費者很難判斷食物是否確實熟透，有些消費者往往追求嫩滑可口，剛熟或半生熟就吃。
提醒，吃火鍋在涮肉類時，應涮至熟透才可吃，以防肉類中有寄生蟲寄生存在；如旋毛蟲多寄生在豬、牛、羊及狗身上；人若吃了會在身體中穿腸入血，令身體不適，產生嘔吐、腹瀉、頭痛及發燒，尤其是腳部及肚子會劇痛，運動不靈活，若進入腦中，會引發腦膜炎，對生命造成威脅。
因此，吃火鍋時，應將生冷的食品原料加熱熟透后食用，做好自身的飲食安全防護工作。同時，勿貪“多”，肉類含脂肪較高，多吃會造成能量過剩，吃得過飽也會使胃腸功能受累，有損健康。
